產(chǎn)品簡介

      當對有限的樣本進行ChIP-Seq時，最大限度地保留已經(jīng)珍貴的樣本是關鍵。Active Motif的Low Cell優(yōu)化模塊使Low Cell ChIP-Seq Kit用戶能夠在協(xié)議進行過程中監(jiān)測樣品保留情況。這種首創(chuàng)的模塊包括“陽性對照”樣品和抗體，以及用于檢測超聲和ChIP富集后染色質數(shù)量和質量的試劑。使用該模塊，研究人員可以在整個ChIP-Seq協(xié)議中監(jiān)測低細胞樣本，識別和優(yōu)化導致樣本丟失的步驟，并通過只處理將產(chǎn)生有價值的ChIP-Seq數(shù)據(jù)的樣本來節(jié)省時間和金錢。

低單元優(yōu)化模塊亮點
“陽性對照”樣品和抗體使用戶能夠優(yōu)化協(xié)議步驟，而不浪費寶貴的樣品
可以在整個方案中檢查染色質的數(shù)量和質量，以快速識別表現(xiàn)不佳的步驟
從低細胞ChIP-Seq套件單獨出售，以便僅在必要時進行優(yōu)化

通過ChIP-Seq協(xié)議檢測低輸入染色質
      該模塊旨在與低細胞ChIP-Seq試劑盒一起使用，在使用寶貴的樣本之前優(yōu)化協(xié)議步驟，或排除協(xié)議中導致樣本丟失的點。低細胞ChIP-Seq試劑盒是足夠強大的工作與高豐度組蛋白修飾和低豐度轉錄因子蛋白。包括下一代DNA文庫和下一代DNA索引試劑，以生成與Illumina?平臺兼容的高復雜性測序文庫。
不要在工作流優(yōu)化上浪費寶貴的樣本
陽性控制樣本(Jurkat細胞顆粒)和抗體(AbFlex?H3K9ac)包含在模塊中，用于低細胞ChIP-Seq協(xié)議的用戶優(yōu)化。這為用戶提供了在使用低輸入、珍貴樣本之前優(yōu)化工作流程條件的能力。這些陽性對照試劑，不提供任何其他低細胞ChIP-Seq試劑盒在市場上，為用戶節(jié)省了優(yōu)化和故障排除他們所關心的樣品協(xié)議的挫折。

低單元優(yōu)化模塊數(shù)據(jù)
在整個ChIP-Seq協(xié)議中檢查低輸入樣本
使用Low Cell ChIP-Seq，研究人員可以減少他們正在研究的細胞數(shù)量，以提高他們對蛋白質- dna相互作用復雜性的理解，使其適用于更有限的細胞群。如果樣品數(shù)量有限，難以培養(yǎng)細胞系，或小組織活檢，該檢測方法是理想的。在整個ChIP- seq協(xié)議中，最大限度地保留有限的樣本是很重要的，這就是為什么Active Motif開發(fā)了一個模塊，在工作流程的中間步驟檢查樣本:在染色質制備和ChIP富集之后(見下面第1天和第4天的紫色步驟)。

染色質制備后確定樣品數(shù)量
低細胞ChIP-Seq試劑盒中使用的許多有限樣本將低于用于DNA定量的常用儀器(例如量子位)的檢測限度。因此，我們建議使用基于qpcr的方法來檢查染色質制備后的樣本，以確保保留足夠的樣本來進行該方案。

分析染色質制備后的樣品碎片
準確的樣本碎片是高質量ChIP-Seq數(shù)據(jù)不可或缺的一部分。低細胞優(yōu)化模塊允許在染色質制備(第1天)之后檢查樣品碎片分布，而不是在NGS文庫制備(第4天)之后。早期檢查碎片允許用戶高效地優(yōu)化樣品超聲處理，而無需在富集和文庫制備上浪費時間和試劑。

確認樣品富集后芯片
為了確保您的樣品的特異性和成功的抗體富集，我們建議使用針對陽性和陰性對照區(qū)域的引物來擴增和表征折疊富集。低細胞優(yōu)化模塊中包含的引物用于H3K9ac抗體。如果使用其他抗體，請檢查Active Motif的ChIP Control qPCR引物集，找到適合目標的引物。

從陽性對照樣品中可視化ChIP-Seq峰值
陽性對照試劑(Jurkat細胞顆粒，H3K9ac抗體和對照引物集)包含在低細胞優(yōu)化模塊中，允許用戶在使用任何寶貴的樣本之前熟悉和排除低細胞ChIP-Seq試劑盒。在檢查染色質質量和數(shù)量后，可以對陽性對照樣品進行測序，以確認ChIP-Seq峰如預期出現(xiàn)